馬來西亞檢疫檢驗局（MAQIS）負責核發農畜產品的進口許可證予進口商、出口商或代理商，並對進口肉類和禽類進行衛生檢驗。此外，所有進口牛肉、羊肉和禽肉製品必須取得馬國認可的清真認證。除了少數產品因保護當地工業或安全考量而受到限制外，很少實施進口數量限制，但某些食品需要有衛生證書、檢驗報告、進口許可和其他許可文件才能進口。
食品進口
進口食品是使用名叫馬來西亞食品安全資訊系統(FoSIM)的線上網路系統處理通知、申報和清關作業，該系統與馬來西亞海關資料庫連接。關於FoSIM之介紹如下：
1. 馬來西亞食品安全資訊系統(FoSIM)成立於2003年，是一套將所有進口入關處與食品安全及品質局串聯起來的網路系統，所有食品進口商或代理商必須向馬來西亞衛生部註冊ID號碼和密碼後，才能進入FoSIM
2. 進口商和代理商必須登入FoSIM提交進口事先通知，確認食品通關時的檢查等級
3. 關於進口通知，進口商或代理商必須先透過海關資訊系統申報進口，再登入FoSIM完成通知程序
4. 每一份進口通知會以網路傳送給衛生部主管官員，以便依檢查等級採取行動。最終決定將以電子化方式傳送給進口商或代理商以及海關
5. 需要檢附衛生證書、檢驗報告或進口許可證可於http://fsq.moh.gov.my
orhttp://fsis2.moh.gov.my/fosimv2查詢。
資料來源：馬國FSQD簡報https://www.fda.gov.tw/tc/includes/GetFile.ashx?mid=133&id=13668&t=s